長崎と鯨との歴史は古く、県下では壱岐の原の辻遺跡から出土した弥生時代の壷に捕鯨を行っている様子が描かれ、捕鯨の歴史は古代まで遡ることができます。

 

また江戸時代から明治にかけては鯨組による捕鯨が盛んに営まれ、「くじら一頭で七浦が潤う」と言われたように、捕鯨は基地周辺の漁村の経済を支えていた時代もありました。鯨は地域経済を潤すだけでなく、祭りや食文化など、長崎市民の生活に密着しており、万屋町の「鯨の潮吹き」、小ケ倉町の「鯨舟」などが有名で、今なお伝統的に受け継がれています。また、鯨重（鯨の料理を揃えたおせち料理を入れた重箱）や鯨雑煮、鯨皮のなますなど、独自の食文化を継承しています。